数据工程师常用的 Shell 命令

MySQL源码分析
yzs87

导读:Linux以其强大的命令行称霸江湖,Shell命令是数据极客的必修兵器。探索性数据分析,在需求和数据都不太明确的环境下,使用各种命令进行一次探索与挖掘。从基础的文件查看到简单的统计,再到一些常用的探索性分析命令,其目的都只是为了更好的做数据分析与挖掘而已。


01 Shell命令行


对于经常和数据打交道的人来说,数据工程师应该也是常常和Linux打交道。Linux以其强大的命令行称霸江湖,因此,Shell命令也是数据极客的必修兵器。


利用Linux命令行的几个命令,就可以完成一些简单的统计分析工作,比如利用wc命令统计文件行,单词数,字符数,利用sort排序和去重,再结合uniq可以进行词频统计。比如:


$ cat file.txt

yunjie

yunjie-talk

yunjie-yun

yunjie

yunjie-shuo

$ sort file.txt | uniq -c | sort -nr | head -5

   2 yunjie

   1 yunjie-shuo

   1 yunjie-talk

   1 yunjie-yun


先用cat命令,了解一下文件的大概格式与内容,发现每行为一个单词。现在需要统计这些单词出现的频率,以及显示出现次数最多的5个单词。


先对文件进行排序,这样相同的单词在紧挨着的行,再后uniq -c 命令,统计不同的单词及各个单词出现的次数。这样得到的结果就是次数后面紧接着单词,然后使用sort -nr对次数进行排序,并逆序显示,最后head命令显示结果的前5行。


非常简单的一种方式,读取文件,排序,统计,再对统计结果进行逆序,最后只显示前几个结果。


类似于sql语句:


select word,count(1) cnt

from file

group by word

order by cnt desc

limit 5;


如果对sql语句熟悉的话,上面的形式应该更容易理解。虽然实现的思想和方式非常简单,但在实际的探索性数据分析中使用却非常频繁。


02 探索性分析


比如在日志分析中,有时并没有非常明确的目标,或者即使有明确的目标,通常各种数据也并没有明确的定义。比如,别人丢给你一个压缩文件,说想分析一下里面有哪些是异常的访问请求。任务描述就是这样,没有更明确的了。


拿到日志文件和这样的分析任务,就需要进行各种可能的探索性分析。先看一下文件的格式,是否压缩过,使用gzip压缩还是tar压缩。解压后,需要先大概了解一下,文件是什么样的格式。对于网络请求的日志文件,是一行一个请求和响应,还是多行一个请求和响应。查看文件有多少行,查看文件占用空间大小。如果解压后包含多个目录或者文件,同样的一个命令,更能发挥强大效果。此时,通常需要如下命令:


gzip/tar:压缩/解压

cat/zcat:文件查看

less/more:文件查看,支持gz压缩格式直接查看

head/tail:查看文件前/后10行

wc:统计行数、单词数、字符数

du -h -c -s:查看空间占用


上面有一个比较有趣的命令组,less和more,这两个都可以分页查看文件。最开始有的more命令,好像是当时more不支持向后翻页。于是一帮人就在此基础上进行了改进,直接叫less,和more同样的功能只是更强大些。因此,也发展出了“less is more”的哲学,“少即是多”,而且少比多更好。这种思想,在产品设计与代码优化中都有体现。


了解文件的大概信息后,可能需要提取一行中某个字段的内容,或者需要搜索某些行出来,或者需要对某些字符或者行进行一定的修改操作,或者需要在众多的目录和文件中找出某此天的日志(甚至找到后需要对这些天的日志进行统一处理),此时下面这些命令可以帮你:


awk:命令行下的数据库操作工具

join/cut/paste:关联文件/切分字段/合并文件

fgrep/grep/egrep:全局正则表达式查找

find:查找文件,并且对查找结果批量化执行任务

sed:流编辑器,批量修改、替换文件

split:对大文件进行切分处理,按多少行一个文件,或者多少字节一个文件

rename:批量重命名(Ubuntu上带的perl脚本,其它系统需要安装),使用-n命令进行测试


如:


# 解压缩日志

$ gzip -d a.gz

$ tar zcvf/jcvf one.tar.bz2 one

# 直接查看压缩日志

$ less a.gz  

# 无需先解压


另外,以z开头的几个命令可以简单处理gzip压缩文件, 如zcat:直接打印压缩文件,还有zgrep/zfgrep/zegrep,在压缩文件中直接查找。


# 查询字符串,并显示匹配行的前3行和后3行内容

fgrep 'yunjie-talk' -A 3 -B 3 log.txt

# 在当前目前(及子目录)下,所有的log文件中搜索字符串hacked by:

$ find . -name "*.log" | xargs fgrep "hacked by"


fgrep, grep, egrep的一些区别:


fgrep按字符串的本来意思完全匹配,里面的正则元字符当成普通字符解析, 如: fgrep “1.2.3.4″ 则只匹配ip地址: 1.2.3.4, 其中的.不会匹配任意字符。fgrep当然会比grep快多了。写起来又简单,不用转义。

grep只使用普通的一些正则,egrep或者grep -E使用扩展的正则,如


egrep "one|two", 匹配one或者two

grep -E -v ".jpg|.png|.gif|.css|.js" log.txt |wc -l


查找所有来自日本的ip的请求,先把所有来源ip取出来,去重,找出日本的ip,放入文件japan.ip,再使用命令:


$ cat log.gz | gzip -d | fgrep -f japan.ip > japan.log


对hive中导出的文件,替换01


cat 0000* | sed 's/x1/ /g' > log.txt


03 其它常用命令


如果文件编码是从windows上传过来的gb2312编码,需要处理成utf8的编码,或者某个日志被黑客后来修改过了,需要和原来的备份数据进行对比,这些工作都是需要数据工程师自己能熟悉的掌握。


假如日志文件是最近一年的请求日志,那么可能是按天或者按小时进行单独存放,此时如果只需要提取某些天(比如周末)的数据,很可能需要处理时间。


因此,下面的一些命令或者工具就很有用了:


date:命令行时间操作函数

sort/uniq:排序、去重、统计

comm:对两个排序文件进行按行比较(共同行、只出现在左边文件、只出现在右边文件)

diff:逐字符比较文件的异同,配合cdiff,类似于github的显示效果

curl/w3m/httpie:命令行下进行网络请求

iconv:文件编码转换,如:iconv -f GB2312 -t UTF8 1.csv > 2.csv

seq:产生连续的序列,配合for循环使用


输出今天/昨天的日期字符串


$ date -d today +%Y%m%d

20160320

$ date -d yesterday +%Y%m%d

20160319


对unix秒的处理


# 当前的时间

$ date +%s

1458484275

$date -d @1458484275

Sun Mar 20 22:31:15 CST 2016


两个文件a.txt, b.txt求只出现在a.txt中的数据:


# 排序两个文件

$ sort a.txt > a.txt.sort

$ sort b.txt > b.txt.sort

# 求只出现在c.sh中的内容

$ comm -2 -3 a.txt.sort b.txt.sort


04 批量操作


对上面的文件进行了一番探索分析后,可能已经有一定的线索或者眉目了,需要更进一步的处理大量的文件或者字段了。此时的步骤也许是一个消耗时间的过程,也许是一个需要看缘分的过程。总之,可能需要综合上面的一些命令,并且对大量的日志进行处理。


这也是体现Shell更强大的一面——批量化的功能了。命令比图形界面的最大优势就是,只需熟悉了,就很容易实现批量化操作,将这些批量化的命令组合成一个文件,于是便产生了脚本。


批量化命令或者脚本,熟悉几个常用的流程控制,就能发挥出强大的性能:


if条件判断:


if [ -d ${base_d} ];

    then mkdir -p ${base_d};

fi


while循环:


while

do

    do_something;

done


for循环(用得很多):


for x in *.log.gz;

do

    gzip -d ${x};

done


这几个条件判断与循环,也可以直接在命令行下使用,区别是多加几个分号隔开即可。


另外,执行长时间的任务,最好直接用nohup来操作。


生成过去8天的日期序列:


$for num in `seq 8 -1 1`;do dd=`date --date="${num} day ago" +%Y%m%d`;echo ${dd};done

20160312

20160313

20160314

20160315

20160316

20160317

20160318

20160319


有目录和文件如下:


20160320 目录

    10.1.0.1_20160320*.log.gz   目录

        201603200000.log.gz          文件

        201603200010.log.gz          文件

    10.1.0.2_20160320*.log.gz   目录

        201603200000.log.gz         文件

        201603200010.log.gz         文件


需求:去掉目录中的*.log.gz,这样很容易让人误解为文件。 rename -n为测试,rename使用和sed相同的语法。


$ for d in 201603??;do echo ${d}; cd ${d}; rename -n 's/*.log.gz//' *.log.gz ; cd ..;done


测试完成后,使用rename不加-n为真正执行重命名操作。


05 结尾


这儿只是简单列举了一些数据分析或者数据处理相关的命令,只能算是Linux的Shell那博大精深的命令中的冰山一角。


但如果能把这些相关的命令融会贯通,并且能实际使用的话,也算是在数据极客之路上多走了一步。


从基础的文件查看到简单的统计,再到一些常用的探索性分析命令,其目的都只是为了更好的做数据分析与挖掘而已。能综合这些命令,并组合起来使用,将命令存放到文件,即产生了Shell脚本。Shell脚本本身也是一门强大的学问了,其中各个命令还有每个命令支持的参数,值得慢慢研究。

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